1、農(nóng)學食糧：人口快速膨脹，食糧問題正是生物技術(shù)應(yīng)用的切入點
在基因克隆農(nóng)作物的開發(fā)下，除了克隆進入抗蟲害基因、抗凍基因外，例如含有維生素A的稻米也問世。在有限耕地下，克隆農(nóng)作物解決了品質(zhì)上的問題。除此之外，觀賞用的花卉等，也靠著組織培養(yǎng)的技術(shù)，將高品質(zhì)的花卉復制生產(chǎn)，提高花卉價值。著名的像是臺灣的蝴蝶蘭。另外，經(jīng)過遺傳工程技術(shù)，能產(chǎn)生凝血因子的乳牛也提供醫(yī)療用途。生物肥料主要利用微生物技術(shù)制作的肥料種類。生物肥料不僅給作物提供養(yǎng)料、改善品質(zhì)、增強抗寒抗蟲害能力、還改善土壤通透性、保水性、酸堿度等理性化特性，可為作物根系創(chuàng)造良好生長環(huán)境，從而保證作物的增產(chǎn)。生物農(nóng)藥（biopesticide）利用微生物、抗生素和基因工程等產(chǎn)生有殺滅蟲病效果的毒素物質(zhì)，生產(chǎn)出廣譜毒力強的微生物菌株制作而成的農(nóng)藥。
2、醫(yī)療領(lǐng)域：在這方面的研究受到極大的注目
像是干細胞應(yīng)用于再生醫(yī)學領(lǐng)域，如人工臟器、神經(jīng)修復等?；蚴且缘鞍踪|(zhì)結(jié)構(gòu)解析數(shù)據(jù)，對于功能性區(qū)域（domain）來開發(fā)相對應(yīng)的抑制劑（如：酵素抑制劑）。利用微陣列核酸芯片，或是蛋白質(zhì)芯片，尋找致病基因。
或是利用抗體技術(shù)，將毒素送入具有特殊標記的癌細胞?；蚶没蚩寺〖夹g(shù)，進行基因治療等?；蛑委煟╣ene therapy）利用分子生物學方法將目的基因?qū)牖颊唧w內(nèi)，使之表達目的基因產(chǎn)物，從而使疾病得到治療，為現(xiàn)代醫(yī)學和分子生物學相結(jié)合而誕生的新技術(shù)。基因治療作為新疾病治療的新手段，給一些難治疾病的根治帶來了光明。
3、軍事科技：基因工程武器簡稱基因武器
例子有：插入眼鏡蛇毒液基因的流感病毒和含有炭疽病毒的大腸桿菌。
4、工業(yè)應(yīng)用：在工業(yè)上，利用工業(yè)菌種的特殊代謝路徑，來替代一些化學反應(yīng)
除了專一性提高，也在常溫常壓下，節(jié)約能源。也由于專一性高，產(chǎn)生的廢棄物量低，也因此被稱為綠色工業(yè)。
5、環(huán)境保護：當環(huán)境受到破壞，可以利用生物技術(shù)的處理方式，讓環(huán)境免于第二次受害
生物具有高度專一性，能針對特殊的污染源進行排除。例如運輸原油的郵輪，因事故，將重油污染海域，而利用分解重油的特殊微生物菌株，對于重油進行分解，代謝成環(huán)境可以接受的短練脂肪酸等，排解污染。此外，土壤遭受重金屬污染，亦可利用特定植物吸收污染源。
